La carrière de Philippe Delaby prend un nouveau tournant lorsqu’il fait la rencontre, pendant un vernissage, du scénariste Jean Dufaux. Ce dernier lui propose d’être le dessinateur de sa nouvelle série, un péplum se déroulant dans la Rome antique. C’est ainsi que paraît en 1997 le premier tome de Murena, qui sera suivi de dix albums répartis en trois cycles. C’est le dessinateur Theo qui assure le dessin des deux derniers albums, parus en 2017 et 2023, après le décès de Delaby en 2014. Le succès public et critique de la série est immédiat, et elle reçoit plusieurs récompenses comme le prix du journal Historia en 2013.

Cette série, qui plante son décor au Ier siècle après Jésus-Christ, entre les règnes des empereurs Claude et Néron, demande à Philippe Delaby des recherches historiques précises. Ainsi, il se documente en lisant des romans, comme Quo Vadis d’Alexandre Dumas ou Moi, Claude de Robert Graves, mais il trouve aussi des inspirations dans le cinéma, comme Ben Hur de William Wyler et Spartacus de Stanley Kubrick. Par ailleurs, la narration très cinématographique et le goût de la précision historique sont également inspirés de la série de bande dessinée Alix de Jacques Martin. Ainsi, Philippe Delaby et Jean Dufaux multiplient les références pour retranscrire une Rome antique mêlant des éléments réels et inventés. 

Ils construisent un univers vraisemblable historiquement, mais aussi palpitant et sulfureux. En effet, Delaby, qui réalise également des illustrations érotiques en parallèle de son activité dans la bande dessinée, a l’habitude d’allier la précision de son dessin à une certaine sensualité. Ainsi, Les Épines, le neuvième tome de Murena, jugé trop érotique par les éditions Dargaud, est modifié par les auteurs avant sa sortie mais la version originale est publiée en tirage limité. En parallèle de Murena, Philippe Delaby succède à Grzegorz Rosiński pour dessiner le deuxième cycle de la série fantasy La Complainte des landes perdues, aussi scénarisée par Jean Dufaux. Il réalise ainsi quatre tomes, qui paraissent aux éditions Dargaud entre 2004 et 2014. Delaby s’éloigne de son registre habituellement historique et met le réalisme de son dessin au service d’une histoire plus fantastique mettant en scène démons et sorcières.